最后的结局是男主角被另一个神秘人物 G-MAN 给控制后关在了一个黑屋子里面，等待的是下一次，也就是半条命3 的使用。 

与其让你沉醉于自由的幻想中，还不如冒昧的替你决断，反正所谓的个人意志也只不过是幻觉。

G-MAN替主人公决断，也就是最终控制权，可怜的FREEMAN，男主人公，最后轰轰烈烈的战斗了一场仍然不能摆脱被人控制的结局